Похожие статьи
В новом исследовании продемонстрировано выделение и секвенирование молекул РНК более чем столетней давности из экземпляра тасманского тигра, хранившегося при комнатной температуре в музейной коллекции. Это позволило впервые реконструировать транскриптом кожи и скелетных мышц вымершего вида.
По словам ученых, полученные ими результаты имеют важное значение для международных усилий по возрождению вымерших видов, включая тасманского тигра и шерстистого мамонта, а также для изучения пандемических РНК-вирусов.
Тасманский тигр, известный также как тилацин, — удивительное хищное сумчатое животное, которое когда-то было широко распространено по всему австралийскому континенту и острову Тасмания. Этот необычный вид окончательно исчез после европейской колонизации, когда он был объявлен сельскохозяйственным вредителем, а в 1888 г. за каждую убитую взрослую особь было назначено вознаграждение в размере 1 фунта стерлингов. Последний из ныне живущих тасманийских тигров умер в неволе в 1936 году в зоопарке Биумарис в Хобарте (Тасмания).
В последнее время усилия по борьбе с вымиранием тигра были сосредоточены на тасманийском тигре, поскольку его естественная среда обитания в Тасмании еще в значительной степени сохранилась, и его реинтродукция могла бы помочь восстановить прежний баланс экосистем, утраченный после его окончательного исчезновения. Однако воссоздание функционально живого тасманийского тигра требует не только полного знания его генома (ДНК), но и динамики экспрессии тканеспецифических генов и работы генной регуляции, что возможно только при изучении его транскриптома (РНК).
«Воскрешение тасманского тигра или шерстистого мамонта — задача нетривиальная и требует глубокого понимания как генома, так и регуляции транскриптома столь известного вида, который только сейчас начинает разгадываться», — рассказывает Эмилио Мармол, ведущий автор исследования, недавно опубликованного в журнале Genome Research учеными SciLifeLab в сотрудничестве с Центром палеогенетики, совместным предприятием Шведского музея естественной истории и Стокгольмского университета.
Исследователи, участвовавшие в этой работе, сначала секвенировали транскриптом кожи и скелетных мышц 130-летнего высушенного экземпляра тасманийского тигра. Это позволило выявить тканеспецифические черты экспрессии генов, сходные с таковыми у живых сумчатых и плацентарных млекопитающих.
Полученные транскриптомы были достаточно качественными для идентификации специфических для мышц и кожи РНК-кодирующих белков и позволили аннотировать недостающие гены рибосомальных РНК и микроРНК, что впоследствии соответствовало требованиям MirGeneDB.
«Таким образом, мы впервые получили представление о существовании регуляторных генов, специфичных для детенышей животных, таких как микроРНК, которые исчезли более века назад», — отмечает Марк Р. Фридлендер, доцент кафедры молекулярных бионаук Института Веннера-Грена Стокгольмского университета и SciLifeLab.
Это новаторское исследование открывает новые захватывающие возможности и последствия для изучения огромных коллекций образцов и тканей, хранящихся в музеях по всему миру, где молекулы РНК могут ожидать открытия и секвенирования.
Эксклюзивный перевод
О светлом будущем заботятся политики, о светлом прошлом – историки, о светлом настоящем – журналисты.
