ФОТО: МАЛИН АРНЕССОН

Cell Reports Methods: анализ сахара может выявить различные типы рака

В будущем небольшого количества слюны может быть достаточно для выявления зарождающегося рака. Исследователи из Гетеборгского университета разработали эффективный способ интерпретировать изменения в молекулах сахара, происходящие в раковых клетках.

Гликаны — это тип структур молекул сахара, которые связаны с белками в наших клетках. Структура гликанов определяет функцию белка. Давно известно, что изменения в структуре гликанов могут указывать на воспаление или заболевание в организме. Теперь исследователи из Гетеборгского университета разработали способ различать различные типы структурных изменений, который может дать точный ответ на то, что изменится при конкретном заболевании.

“Мы проанализировали данные примерно 220 пациентов с 11 различными диагнозами рака и выявили различия в субструктуре гликанов в зависимости от типа рака. Используя наш недавно разработанный метод, усовершенствованный искусственным интеллектом, для обработки больших объемов данных, мы смогли найти эти связи ”, — говорит Дэниел Бохар, младший преподаватель биоинформатики в Гетеборгском университете и ведущий автор исследования, опубликованного в Cell Reports Methods.

Существуют также другие исследовательские группы, которые изучают субструктуру гликанов в поисках так называемых биомаркеров, которые описывают, что не так. Это часто включает статистические тесты с использованием масс-спектроскопии, чтобы выяснить, значительно ли выше или ниже уровень отдельных сахаров при раке. Эти тесты обладают слишком низкой чувствительностью и ненадежны, поскольку различные сахара структурно связаны и, следовательно, не независимы друг от друга.

Исследовательская группа Даниэля Бояра использует новый метод, включающий искусственный интеллект, который учитывает эти проблемы и может находить закономерности в наборах данных там, где другие терпят неудачу.

“Мы можем положиться на наши результаты; они статистически значимы. Если мы знаем, что ищем, нам легче получить правильный результат. Теперь мы возьмем эти биомаркеры и разработаем методы тестирования ”, — поясняет Даниэль Бохар.

Осенью его исследовательская группа получила 4 миллиона шведских крон от Фонда Лундберга на покупку ультрасовременного масс-спектрометра. Этот инструмент послужит платформой искусственного интеллекта для поддержки исследователей в изучении гликанов, например, в образцах рака легких. Цель — выявить рак на ранней стадии, чтобы повысить шансы на выздоровление.

Ученые планируют провести клинические тесты на образцах людей через 4-5 лет.

Поделиться:

Подписывайтесь на краткие, но содержательные новости со всего мира
глазами молодого поколения в Телеграм и ВКонтакте.

Почитайте также

Кембриджские ученые ищут способ борьбы с раком за много лет до его обнаружения

64 Исследователи из Кембриджского университета (Великобритания) активно работают над выявлением клеточных изменений, которые помогут обнаружить …