Похожие статьи
Неизвестные микробы — обычное явление в больницах. Исследователи из Базельского университета потратили много лет на их сбор и анализ. Они идентифицировали множество новых видов бактерий, некоторые из которых имеют важное значение для клинической практики.
Бактериальные инфекции можно лечить более эффективно, если известна причина заболевания. В большинстве случаев все, что требуется для выявления возбудителя, — это анализ в медицинской лаборатории. Однако иногда стандартных методов недостаточно – например, если вид бактерий еще не классифицирован или его особенно трудно выращивать.
Команда из Базельского университета и Университетской больницы Базеля собирает и анализирует образцы пациентов, содержащие такие неизвестные микробы, с 2014 года. Исследователи обнаружили более тридцати новых видов бактерий, некоторые из которых связаны с клинически значимыми инфекциями.
В целом команда под руководством микробиолога доктора Дэниела Голденбергера проанализировала 61 неизвестный бактериальный патоген, обнаруженный в образцах крови или тканей пациентов с широким спектром заболеваний. Обычные лабораторные методы, такие как масс-спектроскопия или секвенирование небольшой части бактериального генома, не дали результатов для всех этих изолятов. Вот почему исследователи секвенировали полный генетический материал бактерий, используя метод, который был доступен всего несколько лет. Затем они сравнили идентифицированные последовательности генома с известными штаммами в онлайн-инструменте.
Из 61 проанализированной бактерии 35 были ранее неизвестны. Исследователи классифицировали оставшиеся 26 штаммов как трудноидентифицируемые: либо последовательности их генома были добавлены в базы данных совсем недавно, либо правильное таксономическое описание патогенов было создано совсем недавно. Оценка данных о пациентах показала, что семь из 35 новых штаммов были клинически значимыми, а это означает, что они могут вызывать бактериальные инфекции у людей.
Работа опубликована в журнале BMC Microbiology.
О светлом будущем заботятся политики, о светлом прошлом – историки, о светлом настоящем – журналисты.
