Похожие статьи
Исследователи из онкологического центра Вандербильта-Ингрэма обнаружили новые гены, которые повышают риск развития рака толстой и прямой кишки у людей.
Ученые провели крупное транскриптомное ассоциативное исследование (TWAS) наряду с альтернативным подходом, называемым сплайсингом-TWAS, для усиления обнаружения генов. Они выявили онкогенную роль двух ранее не сообщавшихся генов, TRPSI и METRNL, и подтвердили восприимчивость к раку с другим недавно зарегистрированным геном, C14orfl66. Результаты были опубликованы в JNCI: Journal of the National Cancer Institute.
«Для выявления новых генов предрасположенности к колоректальному раку необходимы постоянные усилия. В нашем исследовании мы использовали новые данные большого РНК-seq и применили подход TWAS наряду со сплайсингом-TWAS для улучшения обнаружения новых генов. Объединив эти популяционные анализы с функциональными исследованиями, мы можем получить более глубокое представление о биологических механизмах, ответственных за развитие колоректального рака, что может помочь в трансляции генетических результатов для профилактики и лечения этой распространенной злокачественной опухоли «, — рассказывает старший автор исследования Синьи Го, доцент медицины и биомедицинской информатики.
Хотя в ходе общегеномных ассоциативных исследований (GWAS) было обнаружено, что более 200 распространенных генетических вариантов связаны с колоректальным раком, гены-мишени и лежащие в основе биологические механизмы для подавляющего большинства этих локусов риска остаются неясными. Идентифицированные GWAS варианты риска объясняют только около половины наследуемости колоректального рака. Исследования TWAS могут дополнительно точно определить восприимчивость. Альтернативный подход, который использовали исследователи, сплайсинг-TWAS, остается в значительной степени неисследованным при колоректальном раке.
Специалисты провели секвенирование РНК в нормальных тканях толстой кишки и включили данные генотипирования 423 потомков европейцев для построения моделей генетического прогнозирования экспрессии генов и альтернативного сплайсинга.
В общей сложности исследователи идентифицировали 57 генов, связанных с риском развития колоректального рака, после объединения результатов исследований TWAS и splicing-TWAS. О шестнадцати из них не сообщалось в исследованиях GWAS.
Считается, что анализ является первым крупным исследованием, в котором используется подход TWAS для систематического изучения ассоциаций генетически предсказанного альтернативного сплайсинга с риском развития колоректального рака. Будущие анализы TWAS с использованием этих передовых подходов, вероятно, выявят дополнительные значимые гены риска развития рака, заявили исследователи.
Эксклюзивный перевод
О светлом будущем заботятся политики, о светлом прошлом – историки, о светлом настоящем – журналисты.
